ADC Pool Level 01 Preview 结果审核（PROVISIONAL_NOT_AUTHORIZED_FOR_ADVANCEMENT）

docs/handoff/2026-08-05-adc-pool-level-01-preview-result.zh-CN.md

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+# Handoff：ADC Pool Level 01 Preview 结果审核
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+- 日期：`2026-08-05`
+- 任务分支：`task_20260805_adc-pool-level-01-preview-result`
+- 基线：`main` @ `e30a430`
+- 前置：PR #57、#58、#59，均已 `APPROVE` 并合并
+- 交付物类型：**结果审核（外部运行留痕）**
+- 外部运行：`gen_iet_adc_pool_level_01_preview_20260805T160125Z`，**revision 2**（按 2026-08-05 审核裁决修订，见第十一节）
+- **产物状态：`PROVISIONAL_NOT_AUTHORIZED_FOR_ADVANCEMENT`**
+- 架构变更：`NO_ARCHITECTURE_CHANGE`（本 PR 只含本 handoff 与一条 worklog）
+- 审核状态：等待 ChatGPT `APPROVE`。**本 PR 不适用 `AGENTS.md`「审核豁免」。**
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+## 一、这次做了什么，以及它不是什么
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+人类负责人给出明确指令：基于已合并的 #57／#58／#59 契约生成 **ADC Pool Level 01 Preview**，十项约束、六个指定输出，**不得声明为正式执行结果**，完成后只提结果审核 PR，不更新 Level 01 binding、不解除 `EVGAP-01` 或 `EVGAP-02`。
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+指令来自 `Zhixins-KB/2.Biotech/Asset-Generation-OS-architecture.md` 的 `# ADC pool Level 01` 一节（第 20915–21257 行，文件已增长至 21,257 行，只读取未修改）。该节引入 Preview／Accepted 两层拆分，并指出我此前把治理链造得过于串行——「一直在造审核链，而不是造 candidate pool」。这个批评成立，本次按其方案执行。
+
+**这不是正式的 Level 01 执行结果。** 不得作为 Gate 输入、不得进入 Level 02、不得作为资产决策依据。`ADC_POOL_LEVEL_01_ACCEPTED` 只有在 `SRCADM-01`、`EVGAP-01` 抽取结果与 binding、`EVGAP-02` 抽取结果与 binding **五项全部批准**后才能生成。
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+## 二、必须先讲清的治理事实
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+本 Preview 读取了 `ADC_surfaceome_reference@0.3.0`，而**该数据库尚未通过审核**——`SRCADM-01` 未完成，PR #59 的 `admission_record_ref` 为空。
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+这正是：
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+- 22 个靶点只能标 `provisional_surface_eligible`、**不能**标 `eligible_surface_target` 的根本原因；
+- 本 Preview 整体为 provisional 的原因。
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+`source_manifest.json` 中该来源的 `admission_status` 明确记为 `NOT_ADMITTED_PENDING_SRCADM_01`，并附说明。已批准来源只有 `gen_iet_crc_target_enumeration_20260802`（PR #29 `APPROVE`）。
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+被隔离的两次运行（PR #53、#54）列为 `barred_inputs` 且 `used: false`——没有贡献任何场景、靶点、disposition 或结论。
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+## 三、结果
+
+| 量 | 值 |
+|---|---|
+| raw clinical contexts | **9** |
+| raw targets | **41** |
+| Raw Enumeration Matrix | **369** pairs（9 × 41，全部保留） |
+| context 资格 | eligible **1** / hold **8** |
+| target 资格 | `provisional_surface_eligible` **22** / `hold_surface_evidence` **19** |
+| provisional eligible universe index | **22** pairs |
+| `HOLD_PENDING_CRC_LINKAGE` | **22** |
+| `RAW_MATRIX_ONLY` | **347** |
+| LOCK-03 | `unresolved`，**369 / 369** |
+| active-for-Level-02 | **0** |
+| 被排除的候选 | **0** |
+
+### `active = 0` 不等于 pool 为空
+
+它真正表示：**目前没有任何 pair 同时满足三把锁；已有 22 个 pair 形成了 provisional context × target identity 组合，但它们仍同时等待 `EVGAP-01` 的正式接受与 `EVGAP-02` 的 CRC linkage。**
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+这 22 个 pair 的 LOCK-01 状态来自尚未通过 `SRCADM-01` 的 surfaceome 参考库，因此**每一行的 `blocking_evidence_gaps` 都是 `EVGAP-01;EVGAP-02`**（369／369）。
+
+`HOLD` 是待证据，不是否定。369 个 pair 一个都没有被删除或排除。
+
+## 四、判据如何应用
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+**LOCK-02**：按 #58 冻结的 context projection——按 `indication_id` 分组、校验 6 个 context 级字段组内一致且 4 个 endpoint role 齐备、endpoint 折叠为 `endpoint_candidates` 且 `endpoint_maturity = not_locked_at_level_01`。状态上限照旧：1 个 `canonical_c0` → `validated_unmet_context` eligible；7 个 `not_calibrated` derived strategy → `plausible_unmet_context` 强制 DEFER；1 个 `benchmark_only` → `weak_context` 强制 DEFER。
+
+**LOCK-01**：按 #59 冻结的优先级 `E1-05` → `E1-04` → `E1-04b` → `E1-03` → `E1-02` → `E1-01`，每个靶点恰好命中一条。实测规则分布 `E1-01` 22、`E1-02` 6、`E1-03` 3、`E1-04` 6、`E1-04b` **0**、`E1-05` 4——与 #59 契约的 `predicted_result_shape` 逐项一致。
+
+**LOCK-03**：全部 369 个 pair 保持 `unresolved`。`EVGAP-02` 未完成，该锁**无法求值**；没有被猜测、没有取默认值、没有被跳过。
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+## 五、三条必须原样记录的发现
+
+- **`MF-01`：GUCY2C 落 hold。** 在参考库中只有 `curated_knowledge` 一个独立证据家族，`consensus_class` 为 `supported_surface` 而非 `confirmed_surface`。**这与此前多模型共识把 GUCY2C 列为首选、以及被隔离运行（PR #53）的 Tier A 选择相反。** 按实测原样写出，未因与既有偏好冲突而弱化。
+- **`MF-02`：`provisional_surface_eligible` 只表示身份与拓扑层面存在有合理依据的细胞外可及蛋白形式**，不表示在 CRC 肿瘤细胞表面可得。每个 target 行带 `t7_tumor_surface_validated = not_assessed_level_02_scope`。
+- **`MF-03`：零排除。** 没有任何靶点被判 `not_surface_target`。
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+## 六、22 个靶点中两处留给下游的问题
+
+来源文档点名的两处，本次**不在 Level 01 清除**：
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+- **FAP** 很可能主要位于 stromal compartment。LOCK-01 只证明存在细胞外可及形式，不证明它是 tumor-cell target。**该问题属 T7。**
+- **CD274、EGFR、EPCAM** 存在正常组织或 immune-cell expression，将在 **T11** therapeutic-index pre-screen 中分层。
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+两条是同一纪律：Level 01 不代替 Level 02 做判断。
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+Provisional Surface-Eligible Target Set（22）：ADAM9、ADGRG1、ALCAM、CD274、CDH17、CEACAM5、CLDN2、DDR1、EGFR、EPCAM、ERBB2、ERBB3、FAP、FOLR1、MELTF、MSLN、MUC1、NECTIN4、PTK7、ROR1、SLC3A2、TPBG。
+
+hold（19）及原因：独立定位家族数 < 2（CLDN18、**GUCY2C**、LGR5、PRLR、RNF43、SLC44A4）；无细胞外结构域证据（LAMP1、TDGF1、TM4SF1）；定位证据冲突（CD276、F3、IL2RA、MET、MST1R、TACSTD2）；不在参考库中（AG7、CA19-9、EDBN、Undisclosed）。
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+## 七、五种必须避免的混淆，以及机械防护
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+来源文档列出的五条：把 provisional 写成 accepted；把预测数字写成实际运行结果；把 hold 写成 negative；把 Level 01 target identity 写成 T7 tumor surface validation；让 provisional candidate 自动进入 Level 02。
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+本次的防护：**四个 TSV 全部**带 `provisional_only = true` 与 `may_advance_to_level_02 = false`，逐行填充、无空值、取值唯一（revision 2 修正，见第十一节）；`raw_targets.tsv` 与 `pool_level_01_preview.tsv` 另带 `source_admission_status = NOT_ADMITTED_PENDING_SRCADM_01`；target 行带 `t7_tumor_surface_validated = not_assessed_level_02_scope`；`pool_state` 只有 `HOLD_PENDING_CRC_LINKAGE` 与 `RAW_MATRIX_ONLY` 两种取值，不存在任何 `active` 态；manifest 顶层四个状态标记齐备且 `is_formal_level_01_execution_result: false`、`may_be_used_as_gate_input: false`、`may_be_used_for_asset_decisions: false`。
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+## 八、明确没有做什么
+
+- **没有运行任何 Gate、没有赋任何分数、没有排序、没有推荐资产、没有给出实验建议。**
+- 没有评估 T7 或任何肿瘤细胞表面可得性。
+- 没有新增靶点或 clinical context（0 / 0）。
+- 没有排除任何候选（0）。
+- 没有读取 #59 禁读的四个 Level 02 文件（`tumor_surface_measurement.tsv`、`tumor_protein_context.tsv`、`treatment_surface_response.tsv`、`receptor_evidence.tsv`）或禁读字段。
+- 没有引用被隔离运行的任何产物。
+- **没有更新 Level 01 binding，没有解除 `EVGAP-01` 或 `EVGAP-02`。** 两者在 `main` 上仍分别为 `pending_source_admission_and_extraction` 与 `not_completed`。
+- 没有把任何文件写入仓库——产物全部在外部 `DATA` 运行目录。
+- 没有把 `ADC_surfaceome_reference` 纳入已批准来源。
+- 未补 #52／#53／#54／#57／#58／#59 的批准记录（现为六份），事实已查全但未写文件。
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+## 九、验证结果
+
+十项指令约束逐条核验，全部 `PASS`：369 行 Raw Matrix；context projection 与冻结规则一致；22 个 `provisional_surface_eligible` 且全库不出现 accepted `eligible_surface_target`；19 个 hold；LOCK-03 唯一取值 `unresolved`；无任何 active 态且 `may_advance_to_level_02` 全为 false；产物全在外部 `DATA`；四个状态标记齐备；六个指定输出齐备；无 Gate／评分／排序／推荐／建议且零排除零新增。
+
+- 仓库侧：`Ran 309 tests` 全部通过；`scripts/verify_repository_boundary.sh` 通过；`git status --short` 在运行期间保持干净。
+- 七个产物文件的 SHA-256 见附录 A，并已写入 `source_manifest.json`。
+
+## 十、下一步
+
+按来源文档的优先级：**Track A 先做 `EVGAP-02` 契约，Track B 并行做 `SRCADM-01`。** 理由是 Level 01 的价值主要来自「target 为什么与 CRC clinical context 有关」；22 个靶点即使全部通过 surface identity，没有 CRC linkage 仍只是泛癌 surface targets，不是 CRC indication–target seeds。
+
+`EVGAP-02` 的抽取范围来源文档已给定：四类 pair-level linkage（A CRC human tumor expression、B CRC-specific ADC precedent、C CRC-specific target-directed modality evidence 含 CAR-T／bispecific／RIT／immunotoxin／imaging antibody、D context-specific enrichment）与 13 列最小结果 schema。其中 C 类是现有契约尚未涵盖的新增依据，需要在 `EVGAP-02` 契约中加入。
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+## 十一、第一轮审核裁决与修订（`REQUEST_CHANGES`，两条阻断全部接受）
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+ChatGPT 对 PR #60（HEAD `6778a6b`）返回 `REQUEST_CHANGES`。对账部分全部确认正确（9／41／369、22／19、22／347、LOCK-03 369/369 unresolved、无 active、manifest 六个哈希与上传包一致、#53／#54 仍列为 barred inputs、无 Gate score／排序／资产推荐）。两条阻断**全部接受，两条都是我的错**。
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+### 阻断 1（接受）：22 个核心 pair 错误丢失了 `EVGAP-01`
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+22 个 `HOLD_PENDING_CRC_LINKAGE` 行原先写 `blocking_evidence_gaps = EVGAP-02`。
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+**生成逻辑写反了。** 我的代码是 `"EVGAP-02" if in_index else "EVGAP-01;EVGAP-02"`——而恰恰是这 22 个 in-index 的 pair，其 LOCK-01 状态来自尚未通过 `SRCADM-01` 的 `ADC_surfaceome_reference@0.3.0`，最应该同时带 `EVGAP-01`。PR #59 只冻结了抽取契约：没批准数据库、没授权抽取、没解除 `EVGAP-01`、没正式接受 22／19 的判定。
+
+后果是实质的：独立消费 `pool_level_01_preview.tsv` 的下游会误以为 **LOCK-01 已正式通过、只剩 CRC linkage 未完成**。而 target 表其实正确保留了 `EVGAP-01;EVGAP-02`——一进入 pool 行就丢了，这种不一致比统一写错更容易骗过读者。
+
+修订：全部 369 行统一为 `EVGAP-01;EVGAP-02`；in-index 行的 `pool_state_reason` 改为 `provisional_context_and_surface_identity_pending_evgap_01_and_crc_linkage_pending_evgap_02`；报告与本 handoff 的对应表述同步更正。
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+### 阻断 2（接受）：「每个 TSV 都有机械防护」的声明与实际文件不一致
+
+revision 1 的实际情况是：
+
+| 文件 | `provisional_only` | `may_advance_to_level_02` |
+|---|---|---|
+| `raw_clinical_contexts.tsv` | 有 | **无** |
+| `raw_targets.tsv` | 有 | 有 |
+| `raw_enumeration_matrix.tsv` | **无** | **无** |
+| `pool_level_01_preview.tsv` | 有 | 有 |
+
+**所以机械防护并未覆盖每个 TSV，我的声明是事实错误。** 而且这不是纯文案问题——Raw Matrix 很可能被下游单独读取，脱离 manifest 后就会被误用。
+
+修订：按审核方建议统一 schema，四个 TSV 全部加入两列并逐行填充。
+
+### 非阻断增强（已接受）
+
+`raw_targets.tsv` 与 `pool_level_01_preview.tsv` 新增 `source_admission_status = NOT_ADMITTED_PENDING_SRCADM_01`，使治理状态在 TSV 被单独复制或加载时不丢失。
+
+### 按验收标准的复核
+
+- **任何依赖未准入 surfaceome 的 pair 都不再只携带 `EVGAP-02`**：缺 `EVGAP-01` 的行 **0 / 369**。
+- **四个 TSV 逐个读取校验**：两列均存在、无空值、`provisional_only` 唯一值 `true`、`may_advance_to_level_02` 唯一值 `false`，行数 9 / 41 / 369 / 369，全部 `PASS`。
+- PR body、本 handoff、报告与实际 schema 已同步一致。
+
+### 修订未改变的计数
+
+9 contexts、41 targets、369 pairs、22 provisional / 19 hold、22 `HOLD_PENDING_CRC_LINKAGE` / 347 `RAW_MATRIX_ONLY`、LOCK-03 unresolved 369/369、active 0、排除 0——与 revision 1 一致。
+
+manifest 已升为 `revision: 2` 并记录原因；**revision 1 的全部校验和已失效**，七个文件重新计算，见附录 A。
+
+### 审核回写状态
+
+审核方尝试通过 GitHub 连接器提交正式 `REQUEST_CHANGES` review，连接器返回 403，未写回 GitHub。裁决以人类负责人转述为准，已记录于本节与 `logs/worklog.md`。
+
+## 附录 A：产物 SHA-256
+
+| 文件 | SHA-256 |
+|---|---|
+**revision 2 的校验和。revision 1 的全部校验和已失效。**
+
+| 文件 | SHA-256 |
+|---|---|
+| `raw_clinical_contexts.tsv` | `d7084e9553cc56ad06e2ec72fd846b021f6c9e2bf72d5149cdb8d9371926539d` |
+| `raw_targets.tsv` | `1cd9deb9fa3162c40058bb6ae29ac4806037ef87ff358b1bebbd9e2fec76f957` |
+| `raw_enumeration_matrix.tsv` | `4e369201dad43da3be1fe2bb2725d65334365140f2ebea1ec518b60ef7e687f2` |
+| `pool_level_01_preview.tsv` | `24be8810c89feb034114c293f8a6f34b06663c3771d99b3b71c61b1211606340` |
+| `pool_level_01_preview_report.md` | `4cf0e1fce872d6fefcf73d1b020626aa82712079fd7116d6bcabc1c8c1f12c4f` |
+| `external_run_worklog.md` | `9c1149193b8af84c8b62cdc8835fae04a9977602ff7f310d281d498828891037` |
+| `source_manifest.json` | `fbf3c6a4c8eb3b039231394270762de51f788ef52e07ffcdc73e1a4509cfc483` |
+
+运行目录：`external:result/gen_iet_adc_pool_level_01_preview_20260805T160125Z`
+
+### 供上传审核的 revision 2 打包
+
+`external:result/gen_iet_adc_pool_level_01_preview_20260805T160125Z_revision2.zip`
+
+- ZIP SHA-256：`8687e8774b53fda1d3a6fdac38fc56cb0cc2fd198677db5a1f7d5d50a449e823`
+- 24,904 bytes，含且仅含上表七个文件
+- 已从包内回读验证：`manifest revision = 2`、`blocking_evidence_gaps = {'EVGAP-01;EVGAP-02': 369}`、四个 TSV 行数 9／41／369／369 且两个 guard 列齐备
+
+## 十二、第二轮审核裁决：交付包版本不匹配（接受）
+
+ChatGPT 对 PR #60（HEAD `75f7e83`）返回 `REQUEST_CHANGES`，并明确指出**这不是修复逻辑仍有问题，而是被审核的实际结果包版本不匹配**：上传的 ZIP 仍是 revision 1，其中 22 行仍只带 `EVGAP-02`、两个 TSV 仍缺 guard 列、manifest 没有 `revision: 2`。
+
+**裁决成立，问题在交付环节。** 我在 revision 2 修订后只更新了仓库侧的 handoff、PR 描述与校验和，**没有产出一个与之对应的、可上传的结果包**。结果审核必须核验实际文件而不是文档对文件的描述——只同步描述而不同步被审对象，等于让审核方审一份看不到的东西。
+
+### 按六条验收标准对磁盘上的 revision 2 逐条复核
+
+| 验收项 | 结果 |
+|---|---|
+| manifest 明确为 `revision: 2` | `PASS` |
+| 七个文件 SHA-256 与本附录 A 完全一致 | `PASS` |
+| 四个 TSV 两个 guard 列齐备且全行 `true`／`false` | `PASS`（9／41／369／369） |
+| 369 个 pool rows 全部 `EVGAP-01;EVGAP-02` | `PASS`（`{'EVGAP-01;EVGAP-02': 369}`） |
+| 22／19、22／347、369 unresolved 计数不变 | `PASS` |
+| 无 active、accepted、Gate score、T7 validation 或 Level 02 推进授权 | `PASS`（`t7_tumor_surface_validated` 唯一取值 `not_assessed_level_02_scope`） |
+
+### 修订
+
+新增上一节的 revision 2 打包，并记录其自身 SHA-256，使「上传的是哪一版」成为可核对的事实而不是口头声明。包内内容已回读验证。
+
+**此后的规则（自我约束）：** 结果审核 PR 每次修订外部产物，都必须同时产出带版本标识的打包并记录其 SHA-256；只改 handoff 与 PR 描述不算完成交付。
+
+### 审核回写状态
+
+审核方尝试通过 GitHub 连接器提交正式 `REQUEST_CHANGES` review，连接器返回 403，未写回 GitHub。裁决以人类负责人转述为准，已记录于本节与 `logs/worklog.md`。