final-version

HPC-Organoid-Quant is a modular image analysis pipeline for quantifying organoids in brightfield microscopy images, with optional GFP analysis. It handles fragmented structures, extracts key features, and outputs visual overlays and CSV reports. Runs in Google Colab or locally via Conda or Python venv.

Ontwerp en maak voor een opdrachtgever een interface waar gebruikers blij van worden