Skip to content

LUA-RLP/luaRlp

Folders and files

NameName
Last commit message
Last commit date

Latest commit

 

History

227 Commits
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Repository files navigation

R Nutzung am LUA RLP

Unsere Web-Apps sind (nur) innerhalb des Netzwerkes des LUA RLP unter dieser Adresse zu finden.

R package luaRlp

Weiter Funktionen stehen für R-Nutzer innerhalb unsers Pakets zu Verfügung. Nutzer, welche R-Code auch in der Kommandozeile ausführen möchsten, können zum Installieren des Pakets folgenden Code ausführen (dies ist nur bei der ersten Installation oder bei Updates notwendig):

install.packages("remotes")

remotes::install_github("derele/luaRlp", build_vignettes = TRUE)

Falls Probleme bei der Installation auftauchen sind diese meist durch eine fehlende Proxy-Konfiguration verursacht. Diese lassen sich (innerhalb des LUA) durch Ausführen des folgenden Codes lösen:

source("O:/Abteilung Humanmedizin (AHM)/Referat 32/R_setup/lua_proxy_networking.R")

Danach sollte die Installation durchführbar sein.

Das Paket Laden mit

library(luaRlp)
## survnet.dsn ist gesetzt auf: SurvNet_datenbank

Das Paket hat mehrere wichtige Funktionen für unsere Amtsaufgaben:

  • es kann epidemiologische Daten aus SurvNet zu unseren Labornummern hinzufügen. Mehr dazu via
vignette("EpiData_RIDOM")
  • es kann eine Re-Evaluierung der bioionformatischen Pipelines am LUA-RLP durchführen. Mehr dazu via
vignette("QM_pipeline_evaluation")

Diese Art der Dokumentation stellt sicher, dass die Funktionen wie Dokumentiert auf dem Rechner des Nutzers ausführbar sind (die Funktionen werden lokal auf dem Nutzer-Rechner ausgeführt um die Dokumentation zu erstellen).

About

R Paket zur Standardisierung und Konfiguration am LUA RLP

Resources

License

Stars

2 stars

Watchers

2 watching

Forks

Releases

No releases published

Packages

 
 
 

Contributors