🎓 Academic Forge

面向 Claude Code / OpenCode / Codex 的学术 Skill 选配与安装平台

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✨ 新增： Claude Science内置的 32 个技能

• 覆盖发表级图表、文献综述、远程算力、蛋白质结构与设计、基因组、单细胞等
• 无需订阅 Claude Science 即可安装，跨 agent 通用（Claude Code / OpenCode / Codex），支持 Windows（PowerShell 安装脚本）
• 作为本地维护集合收录在 skills/claude-science，在目录中归类为「流程与方法 · Claude Science」，其下每个技能再按科研 / 写作 / 图表等分类展示

🔨 什么是 Academic Forge

"Forge（锻造台）" 灵感来自 Minecraft 的模组加载器系统——就像 Minecraft Forge 整合包为特定游戏体验集成各种模组一样，Academic Forge 把散落各处的学术 AI 技能，锻造成一套趁手的工具箱。🎓

不用整仓复制全部 skill，三步搞定：

1. 🖱️ 在站点里浏览、勾选需要的 pack
2. 📋 一键生成安装命令
3. ⚡ 在自己的项目根目录里执行

🚀 快速开始

🖱️ 方式一：使用选配站

打开 https://hughyau.com/AcademicForge/，勾选需要的 skill pack、选择你的平台（Claude Code / OpenCode / Codex），一键生成安装命令。

demo_github.mp4

⌨️ 方式二：直接运行安装脚本

macOS / Linux:

cd your-project
curl -sSL https://raw.githubusercontent.com/HughYau/AcademicForge/refs/heads/site-first/scripts/forge-install.sh | bash -s -- \
  --tool claude \
  --skills humanizer,superpowers

Windows PowerShell:

cd your-project
$script = Join-Path $PWD 'forge-install.ps1'
Invoke-WebRequest -Uri 'https://raw.githubusercontent.com/HughYau/AcademicForge/refs/heads/site-first/scripts/forge-install.ps1' -OutFile $script
& $script -Tool claude -Skills 'humanizer,superpowers'
Remove-Item $script

已安装的同名 skill 会被跳过并提示；追加 --force（PowerShell 为 -Force）可覆盖更新。

🤖 方式三：让你的 AI 替你挑选

不知道选什么？把下面这段提示词交给你的 AI 智能体（Claude Code / OpenCode / Codex 均可）：

请获取并阅读 https://hughyau.github.io/AcademicForge/agents.md，按其中的说明了解我的研究需求，然后从 AcademicForge 目录中为我挑选合适的学术 skills 并生成安装命令。

🔬 Claude Science 技能清单（32 个）

下面按主题整理了 skills/claude-science 收录的全部 32 个技能。只想安装这一套：

curl -sSL https://raw.githubusercontent.com/HughYau/AcademicForge/refs/heads/site-first/scripts/forge-install.sh | bash -s -- --tool claude --skills claude-science

六大主题：🧬 结构预测与对接 · ✏️ 蛋白质设计与嵌入 · 🧫 基因组与单细胞 · 📊 图表与可视化 · ✍️ 文献与写作 · ⚙️ 算力与工作流

展开查看全部 32 个 Claude Science 技能

🧬 结构预测与对接（6）

Skill	用途
alphafold2	AlphaFold2 / AF2-Multimer 折叠单体与复合物（ColabFold 运行器）
openfold3	AlphaFold3 的开源权重 PyTorch 复现（AlQuraishi Lab）
boltz	Boltz-2 预测蛋白 / 核酸 / 小分子复合物，可选结合亲和力
chai1	Chai-1 基础模型预测抗体-抗原、蛋白-配体复合物
esmfold2	Biohub ESMFold2 / ESMFold2-Fast 全原子共折叠
diffdock	DiffDock-L 预测小分子结合构象（分子对接）

✏️ 蛋白质设计与嵌入（4）

Skill	用途
proteinmpnn	对蛋白骨架逆折叠生成氨基酸序列
ligandmpnn	带配体 / 核酸 / 金属上下文的逆折叠
solublempnn	面向可溶性重训的 ProteinMPNN 变体
fair-esm2	用 Meta ESM-2 生成蛋白质嵌入表征

🧫 基因组与单细胞（4）

Skill	用途
borzoi	从 DNA 序列预测全基因组功能轨迹（RNA-seq/CAGE/DNase/ChIP）
evo2	长上下文基因组基础模型：打分 / 嵌入 / 生成 DNA
scgpt	单细胞基础模型 scGPT：嵌入与细胞注释
scvi-tools	概率式单细胞 RNA-seq（scVI / scANVI + 贝叶斯差异表达）

📊 图表与可视化（4）

Skill	用途
figure-composer	组合出版级多面板图
figure-style	出版级图表正确性与可读性规范
algorithmic-art	用 p5.js 创作算法 / 生成艺术
web-artifacts-builder	构建复杂的 claude.ai HTML 交互产物（React/Tailwind/shadcn）

✍️ 文献与写作（4）

Skill	用途
literature-review	检索、核验并综合科学文献
paper-narrative	审视并重塑论文图表讲述的“故事线”
indication-dossier	生成治疗适应症档案（indication dossier）
pdf-explore	跨整篇 PDF / 论文定位、比较与抽取内容

⚙️ 算力与工作流（10）

Skill	用途
compute-env-setup	在远程算力上搭建运行环境
remote-compute-modal	在你自己的 Modal 账户上运行 GPU 任务
remote-compute-ssh	SSH / SLURM 主机的提交 → 等待 → 回收工作流
managed-model-endpoints	注册本地 / 远程模型服务端点
using-model-endpoint	通过原生 HTTP API 调用已注册的模型端点
self-awareness	对 Claude Science 会话数据库 / SDK 做自省
skill-creator	创建、改进并评测 skill
customize	自定义 agent 画像并创作新 skill
learn	面向“理解原理”的学习 / 讲解型 skill
product-self-knowledge	涉及 Anthropic 产品事实时先自查核对

📚 文档

• 快速入门
• Skill 归属

⭐ Star History

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📄 许可证

• 仓库结构、站点、脚本和本地内容采用 MIT
• 第三方 skill 保留其各自许可证与作者信息