Fix tests and unix postinstall

README.md

@@ -6,11 +6,21 @@ Standaard setup voor python-projects bij HHNK. In de repo staan een aantal voorb
 Onderstaand staat uitgewerkt welke software wordt gebruikt, hoe testen opgezet kunnen worden, projectopzet en meer.
 
 # Installatie
+## Lokaal
 Om deze repo goed neer te zetten moeten een aantal stappen worden genomen:
-- `git clone` -> Clone de repo
+- `git clone https://github.com/HHNK/python-workflow-demo` -> Clone de repo
 - `pixi install` -> installeer de python environment (draai dit in de repo;`cd python-workflow-demo`)
 - `pixi run postinstall`
 
+## Codespaces
+Github Codespace geven een platform om zonder installaties in de cloud ook te werken met een github branch en vs-code. Via de hoofdpagina van de repo https://github.com/HHNK/python-workflow-demo klikken op de groene `Code` rechtsboven en vanuit daar een Codespace aanmaken.
+
+Vervolgens moet de environment geinstalleerd worden en enkele vs-code extensions (zie (# IDE )). Verdere stappen
+- `curl -fsSL https://pixi.sh/install.sh | sh` in terminal vs-code -> install pixi
+- ctrl+shift+` -> restart shell
+- `pixi install`
+- `pixi run postinstall`
+
 # IDE
 Voor de developer environment zijn er veel opties, we gebruiken [Visual Studio Code](https://code.visualstudio.com/download). Dit biedt goede integratie van notebooks en tal van andere extensions. Uiteindelijk zal persoonlijke voorkeur ook meespelen in de keuze. Om samenwerking binnen het team te bevorderen maken we alleen gebruik van vs-code.
 
@@ -198,4 +208,6 @@ De resultaten zijn op de repo te zien onder [Actions](https://github.com/HHNK/py
 
 
 # AI helpers
-Zelf thuis een [Ollama](https://ollama.com/) installatie draaien waarmee je lokaal AI kan draaien. Met de [Continue](https://docs.continue.dev/getting-started/install) extension zijn code-hints mogelijk zonder de limieten van de free-tier van [Copilot](https://code.visualstudio.com/docs/copilot/overview). Hiervoor is wel een redelijke GPU nodig. Ervaring tot nu is net iets minder dan de online tools.
+Zelf thuis een [Ollama](https://ollama.com/) installatie draaien waarmee je lokaal AI kan draaien. Met de [Continue](https://docs.continue.dev/getting-started/install) extension zijn code-hints mogelijk zonder de limieten van de free-tier van [Copilot](https://code.visualstudio.com/docs/copilot/overview). Hiervoor is wel een redelijke GPU nodig. Ervaring tot nu is net iets minder dan de online tools.
+
+

bin/install_hrt.sh

@@ -0,0 +1,13 @@
+#!/bin/bash
+set -e  # Exit on error
+
+# Optional: echo commands for debugging
+# set -x
+
+# Check if the directory ../hhnk-research-tools exists
+if [ ! -d "../hhnk-research-tools" ]; then
+    git clone https://github.com/HHNK/hhnk-research-tools/ ../hhnk-research-tools
+fi
+
+# Install the package in editable mode without dependencies
+pip install --no-deps -e ../hhnk-research-tools

bin/install_htt.sh

@@ -0,0 +1,10 @@
+#!/bin/bash
+set -e  # Exit on any error
+
+# Clone the repo if it doesn't exist
+if [ ! -d "../hhnk-threedi-tools" ]; then
+    git clone https://github.com/threedi/hhnk-threedi-tools/ ../hhnk-threedi-tools
+fi
+
+# Install with the same pip flags as in the Windows script
+pip install --no-build-isolation --no-deps --disable-pip-version-check -e ../hhnk-threedi-tools