Este repositório tem como objetivo a produção dos produtos do projeto já realizados para municípios, estados, etc., para escala espacial mais fina (intramunicipal).
Os produtos disponíveis no boletim intramunicipal são:
- curva de incidência com nowscast e níveis de alerta para o município;
- curva de incidência com nowscast e níveis de alerta em escala intramunicipal (joinville - distritos, recife - rpa);
- comparação histórica município;
- Rt município;
- Rt intramunicipal;
- Mapa de incidência intramunicipal;
- Receptividade climática
Na raiz do diretório está o script "funcoes_submunicipal.R" que concatena toda as funções necessárias para execução do boletim.
Até o momento, os municípios incluídos são: Joinville, Recife e Brasília. Cada um destes municípios possui sua própria pasta com o arquivo .qmd que gera o boletim de cada município individual, um RData com os arquivos de referência necessários (código de identificação dos bairros, shapefiles da escala intramunicipal, população dos bairros). Durante a execuação do .qmd, o arquivo "cabeçalho_municipio.tex" para incluir informação da SE vigente no cabeçalho do boletim.
Em cada pasta de município, está o .qmd para gerar o boletim intramunicipal. Para construir o boletim são necessários os dados abaixo de cada município: 1.tabela.historico_alerta - dengue; 2.tabela.historico_alerta - chik; 3.tabela.notificação
Para realizar testes, estes dados são baixados da API e salvos no diretório "dados_intramunicipal_teste/joinvile/sexx". Dessa forma são efetuados eventuais debugs no código.
Também está na raiz do diretório o arquivo "boletim_intramunicipal_consolidado.qmd" que é uma proposta de .qmd generalizável para qualquer município que entre na análise intramunicipal. A partir da identificação do código do município, os produtos específicos para o município são gerados.